Der Sumpfbärlapp (Lycopodiella inundata) ist in Deutschland selten in Hochmooren auf offenem Torfschlamm oder Lebermoosen zu finden. Er wächst auch auf Schwingdecken im Verlandungsgürtel von Seen, also unter etwas günstigeren Nährstoffverhältnissen sowie auf nassem Sand mit gewissem Humusanteil. 

In der borealen Zone finden wir ihn zerstreut in den tieferen Lagen in Mooren, auf nassem Sand (auch gelegentlich am Ufer von Braunwasserseen).

Allgemein wächst er auf sauren (Torf)-Böden.